Комиссией организационно-инспекторского управления Государственного таможенного комитета РФ с 15 октября 2001 года проводится проверка деятельности Северо-Западного таможенного управления. От исполнения служебных обязанностей отстранены ряд руководителей управления, в том числе начальник СЗТУ Владимир Шамахов и начальник Балтийской таможни Александр Пучков. На эти должности временно назначены чиновники из ГТК РФ, входящие в состав комиссии. По некоторым данным, для сотрудников СЗТУ визит московских проверяющих и последовавшие за этим кадровые решения стали полной неожиданностью, что само по себе уже удивительно. Как показывает практика, о ведомственных проверках в силовых структурах знают заранее, готовятся к ним и нередко прогнозируют последствия "московских десантов". Абсолютно логично в данном случае выглядит отдельное внимание проверяющих именно к Балтийской таможне. По статистике внешнеэкономической деятельности России, СЗТУ занимает второе место по объемам импорта и третье - по объемам таможенных платежей. В состав СЗТУ входят 23 таможни. При этом на долю только Балтийской таможни приходится около 34% всех платежей, взимаемых региональным управлением. Дело в том, что под контролем Балтийской таможни находится Морской порт Санкт-Петербурга, который по праву считается внешнеэкономическим "окном в Европу" для России. Именно Балтийскую таможню можно по праву назвать залогом успешных финансовых показателей всего регионального управления и одновременно источником компрометирующей информации. В России большие деньги традиционно связаны с повышенной криминализацией. Справедливо это и для околотаможенного бизнеса. Кроме того, непосредственно вокруг деятельности Морского порта Санкт-Петербурга часто возникали скандалы. Поэтому и Балтийская таможня нередко фигурировала в различного рода конфликтах. Наиболее "громкие" скандалы последних лет были связаны с импортом продовольствия.
